Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms