Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SREBF2Q12772 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SREBF2Q12772 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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