Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OC90Q02509 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OC90Q02509 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OC90Q02509 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OC90Q02509 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OC90Q02509 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OC90Q02509 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OC90Q02509 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OC90Q02509 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OC90Q02509 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
OC90Q02509 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
OC90Q02509 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
OC90Q02509 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OC90Q02509 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OC90Q02509 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OC90Q02509 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OC90Q02509 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OC90Q02509 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OC90Q02509 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OC90Q02509 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OC90Q02509 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OC90Q02509 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OC90Q02509 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
OC90Q02509 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OC90Q02509 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
OC90Q02509 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OC90Q02509 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms