Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DSC2Q02487 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms