Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAP1Q01518 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAP1Q01518 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms