Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTBN1Q01082 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms