Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDL3P58872 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms