Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BACE1P56817 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BACE1P56817 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BACE1P56817 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BACE1P56817 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BACE1P56817 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BACE1P56817 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BACE1P56817 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BACE1P56817 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BACE1P56817 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BACE1P56817 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BACE1P56817 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BACE1P56817 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BACE1P56817 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BACE1P56817 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BACE1P56817 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BACE1P56817 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BACE1P56817 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BACE1P56817 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BACE1P56817 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BACE1P56817 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BACE1P56817 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BACE1P56817 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BACE1P56817 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BACE1P56817 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BACE1P56817 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BACE1P56817 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BACE1P56817 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BACE1P56817 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BACE1P56817 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BACE1P56817 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BACE1P56817 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BACE1P56817 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BACE1P56817 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BACE1P56817 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BACE1P56817 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BACE1P56817 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BACE1P56817 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BACE1P56817 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BACE1P56817 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BACE1P56817 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BACE1P56817 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BACE1P56817 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms