Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-DMAP28067 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms