Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NFKBIAP25963 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFKBIAP25963 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms