Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL3L1P16619 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms