Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLI3P10071 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLI3P10071 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GLI3P10071 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLI3P10071 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLI3P10071 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLI3P10071 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLI3P10071 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLI3P10071 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLI3P10071 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLI3P10071 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLI3P10071 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLI3P10071 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLI3P10071 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLI3P10071 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GLI3P10071 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GLI3P10071 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GLI3P10071 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GLI3P10071 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GLI3P10071 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GLI3P10071 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GLI3P10071 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GLI3P10071 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GLI3P10071 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GLI3P10071 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GLI3P10071 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GLI3P10071 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GLI3P10071 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GLI3P10071 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GLI3P10071 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GLI3P10071 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI3P10071 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI3P10071 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms