Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM225BP0DP42 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms