Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF1RP07333 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms