Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFMP07197 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFMP07197 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFMP07197 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFMP07197 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFMP07197 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFMP07197 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFMP07197 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFMP07197 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFMP07197 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFMP07197 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFMP07197 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFMP07197 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFMP07197 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFMP07197 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFMP07197 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFMP07197 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFMP07197 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFMP07197 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFMP07197 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFMP07197 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFMP07197 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFMP07197 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFMP07197 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFMP07197 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFMP07197 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFMP07197 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFMP07197 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFMP07197 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFMP07197 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFMP07197 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFMP07197 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFMP07197 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFMP07197 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFMP07197 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFMP07197 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFMP07197 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFMP07197 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFMP07197 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFMP07197 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFMP07197 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFMP07197 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFMP07197 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFMP07197 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFMP07197 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFMP07197 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFMP07197 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFMP07197 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFMP07197 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFMP07197 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFMP07197 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFMP07197 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFMP07197 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFMP07197 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFMP07197 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFMP07197 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFMP07197 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFMP07197 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFMP07197 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms