Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX58O95786 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX58O95786 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX58O95786 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX58O95786 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX58O95786 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX58O95786 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX58O95786 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX58O95786 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX58O95786 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX58O95786 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX58O95786 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX58O95786 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX58O95786 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX58O95786 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX58O95786 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX58O95786 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX58O95786 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX58O95786 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX58O95786 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX58O95786 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX58O95786 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX58O95786 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX58O95786 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX58O95786 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX58O95786 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX58O95786 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX58O95786 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX58O95786 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX58O95786 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX58O95786 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX58O95786 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX58O95786 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX58O95786 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX58O95786 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX58O95786 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX58O95786 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX58O95786 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX58O95786 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX58O95786 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX58O95786 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX58O95786 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX58O95786 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX58O95786 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX58O95786 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX58O95786 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX58O95786 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX58O95786 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX58O95786 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX58O95786 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX58O95786 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX58O95786 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX58O95786 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX58O95786 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX58O95786 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX58O95786 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX58O95786 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX58O95786 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX58O95786 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX58O95786 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX58O95786 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX58O95786 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX58O95786 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX58O95786 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX58O95786 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX58O95786 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX58O95786 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX58O95786 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX58O95786 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX58O95786 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX58O95786 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX58O95786 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX58O95786 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms