Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDE8BO95263 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDE8BO95263 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms