Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBF1O95248 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBF1O95248 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBF1O95248 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBF1O95248 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBF1O95248 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBF1O95248 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBF1O95248 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBF1O95248 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SBF1O95248 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBF1O95248 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SBF1O95248 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SBF1O95248 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBF1O95248 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBF1O95248 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBF1O95248 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBF1O95248 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBF1O95248 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBF1O95248 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBF1O95248 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBF1O95248 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBF1O95248 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBF1O95248 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBF1O95248 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBF1O95248 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBF1O95248 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBF1O95248 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBF1O95248 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBF1O95248 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SBF1O95248 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBF1O95248 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBF1O95248 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBF1O95248 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SBF1O95248 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SBF1O95248 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBF1O95248 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBF1O95248 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBF1O95248 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SBF1O95248 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBF1O95248 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBF1O95248 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBF1O95248 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBF1O95248 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBF1O95248 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBF1O95248 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBF1O95248 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBF1O95248 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBF1O95248 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SBF1O95248 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms