Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ZNF253O75346 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ZNF253O75346 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ZNF253O75346 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ZNF253O75346 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF253O75346 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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