Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTATSF1O43719 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms