Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN25C9JDP6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms