Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRDCB7Z8K6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRDCB7Z8K6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms