Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVV-2B6SEH9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVV-2B6SEH9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms