Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NOTOA8MTQ0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NOTOA8MTQ0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms