Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms