Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
LAMA3Q16787 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms