Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
FOXD1Q16676 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXD1Q16676 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms