Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SGCAQ16586 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SGCAQ16586 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
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