Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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SEC23BQ15437 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23BQ15437 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SEC23BQ15437 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23BQ15437 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23BQ15437 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23BQ15437 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SEC23BQ15437 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23BQ15437 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23BQ15437 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SEC23BQ15437 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SEC23BQ15437 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23BQ15437 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SEC23BQ15437 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SEC23BQ15437 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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SEC23BQ15437 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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SEC23BQ15437 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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SEC23BQ15437 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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SEC23BQ15437 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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SEC23BQ15437 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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SEC23BQ15437 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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SEC23BQ15437 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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SEC23BQ15437 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23BQ15437 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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