Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PCOLCEQ15113 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PCOLCEQ15113 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 346.3 ms