Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
NCAPHQ15003 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NCAPHQ15003 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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