Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
SSPNQ14714 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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