Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKP1Q13835 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms