Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.46□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
FHL3Q13643 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
FHL3Q13643 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FHL3Q13643 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FHL3Q13643 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FHL3Q13643 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FHL3Q13643 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FHL3Q13643 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FHL3Q13643 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FHL3Q13643 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FHL3Q13643 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FHL3Q13643 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FHL3Q13643 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FHL3Q13643 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FHL3Q13643 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FHL3Q13643 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms