Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PWP1Q13610 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.3 ms