Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
AP3B2Q13367 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 558.9 ms