Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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TRAF1Q13077 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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TRAF1Q13077 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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TRAF1Q13077 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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TRAF1Q13077 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRAF1Q13077 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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TRAF1Q13077 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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TRAF1Q13077 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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TRAF1Q13077 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRAF1Q13077 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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