Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
HOXD11P31277 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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