Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SH3BP4Q9P0V3 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SH3BP4Q9P0V3 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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