Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
EHD3Q9NZN3 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
EHD3Q9NZN3 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
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