Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TDP1Q9NUW8 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TDP1Q9NUW8 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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