Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPROQ16827 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPROQ16827 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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