| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-948P-201 | ENST00000516374 | 107 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU2-34P-201 | ENST00000516534 | 121 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-1088P-201 | ENST00000516850 | 104 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-273P-201 | ENST00000516937 | 96 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-548P-201 | ENST00000517083 | 115 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORA31.24-201 | ENST00000517232 | 57 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC023200.1-201 | ENST00000519660 | 651 nt | TSL 3 BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC084816.1-207 | ENST00000538317 | 584 nt | TSL 4 BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNHG14-219 | ENST00000553134 | 470 nt | TSL 2 BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC022035.1-201 | ENST00000579923 | 302 nt | TSL 2 BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC006504.8-201 | ENST00000621046 | 635 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC009033.1-201 | ENST00000624279 | 431 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL359697.1-201 | ENST00000624879 | 587 nt | BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | NCBP1-205 | ENST00000629069 | 249 nt | TSL 5 BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | PTPN22-206 | ENST00000525799 | 2118 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.28 | □□□□□ -2.2 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | BRDT-206 | ENST00000402388 | 3125 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORA33-201 | ENST00000363664 | 130 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU4-13P-201 | ENST00000364019 | 141 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-1019P-201 | ENST00000364424 | 107 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | Y_RNA.295-201 | ENST00000364918 | 102 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU4-9P-201 | ENST00000364951 | 139 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-831P-201 | ENST00000384548 | 107 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR586-201 | ENST00000385035 | 97 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR548B-201 | ENST00000385247 | 97 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORD115-47-201 | ENST00000391226 | 86 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNA5SP504-201 | ENST00000410676 | 117 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | NAALADL2-AS1-201 | ENST00000426315 | 804 nt | TSL 5 BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | LINC02541-201 | ENST00000427157 | 327 nt | TSL 3 BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RPS29P29-201 | ENST00000456396 | 171 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC114982.1-201 | ENST00000469402 | 321 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | LINC02276-201 | ENST00000508388 | 138 nt | TSL 3 BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | ACA59.1-201 | ENST00000515966 | 143 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-864P-201 | ENST00000516256 | 108 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL160236.1-201 | ENST00000556317 | 195 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORA77B-201 | ENST00000578179 | 125 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AP001496.1-201 | ENST00000579113 | 471 nt | TSL 4 BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC124303.1-201 | ENST00000605703 | 360 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR6845-201 | ENST00000613182 | 61 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | U4.5-201 | ENST00000617137 | 123 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC006001.4-201 | ENST00000622243 | 395 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR3688-2-201 | ENST00000636963 | 87 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC007370.2-201 | ENST00000506899 | 2694 nt | TSL 5 BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MGAT4C-207 | ENST00000552808 | 1937 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORD115-8-201 | ENST00000363856 | 82 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORD115-32-201 | ENST00000364079 | 82 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORA63D-201 | ENST00000364359 | 132 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORD115-38-201 | ENST00000365037 | 82 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-1215P-201 | ENST00000384441 | 102 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR150-201 | ENST00000385048 | 84 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORA67.6-201 | ENST00000391093 | 99 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR548F1-201 | ENST00000408667 | 84 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-57P-201 | ENST00000411348 | 103 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL355314.2-201 | ENST00000427182 | 436 nt | TSL 3 BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL445305.1-201 | ENST00000432577 | 575 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | HMGN2P34-201 | ENST00000437647 | 269 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL024497.2-201 | ENST00000457081 | 317 nt | TSL 3 BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RPL26P26-201 | ENST00000480251 | 434 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RPL30P10-201 | ENST00000488148 | 337 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC091976.1-202 | ENST00000509211 | 630 nt | TSL 3 BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | TRAPPC2P7-201 | ENST00000509650 | 231 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-344P-201 | ENST00000516635 | 111 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU1-117P-201 | ENST00000517041 | 158 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC100801.1-202 | ENST00000518266 | 371 nt | TSL 3 BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC027288.2-201 | ENST00000553028 | 243 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC002558.3-201 | ENST00000574021 | 401 nt | TSL 3 BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC099518.4-202 | ENST00000576433 | 455 nt | TSL 2 BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AP005120.1-201 | ENST00000579321 | 352 nt | TSL 3 BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6ATAC35P-201 | ENST00000609276 | 444 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC090517.2-201 | ENST00000614966 | 680 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC008873.1-201 | ENST00000625051 | 138 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR3662-201 | ENST00000637030 | 95 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RBMS2-209 | ENST00000639027 | 192 nt | TSL 5 BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | CHST9-202 | ENST00000581714 | 2043 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | HFM1-201 | ENST00000370425 | 4931 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | ZNF404-202 | ENST00000587539 | 1851 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | snoU2-30.2-201 | ENST00000362805 | 70 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-414P-201 | ENST00000363705 | 104 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6ATAC2P-201 | ENST00000387943 | 126 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR320B2-201 | ENST00000408479 | 138 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU2-7P-201 | ENST00000410794 | 178 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | CST2P1-201 | ENST00000425770 | 87 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SDAD1P3-201 | ENST00000427380 | 333 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MTATP6P13-201 | ENST00000438531 | 667 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | LINC01710-201 | ENST00000446002 | 390 nt | TSL 5 BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC112492.4-201 | ENST00000456549 | 352 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU7-57P-201 | ENST00000459540 | 60 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | HMGN1P13-201 | ENST00000505795 | 138 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNA5SP54-201 | ENST00000516951 | 92 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-58P-201 | ENST00000517143 | 103 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | CARD18-203 | ENST00000532895 | 422 nt | TSL 2 BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC008269.2-201 | ENST00000561915 | 1105 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORD53B-201 | ENST00000577887 | 78 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AP001109.1-201 | ENST00000587114 | 279 nt | TSL 3 BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AP001485.1-201 | ENST00000604799 | 199 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | PRR13P7-201 | ENST00000605538 | 430 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | GNAS-AS1_4.1-201 | ENST00000616546 | 112 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC095038.3-201 | ENST00000634439 | 195 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | CEP162-202 | ENST00000403245 | 5156 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC091812.1-201 | ENST00000432235 | 1948 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | Y_RNA.67-201 | ENST00000362870 | 100 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |