Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
ATP6AP1Q15904 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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