Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRIM25Q14258 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRIM25Q14258 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.6 ms