Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
APOFQ13790 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
APOFQ13790 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
APOFQ13790 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
APOFQ13790 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
APOFQ13790 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
APOFQ13790 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
APOFQ13790 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
APOFQ13790 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
APOFQ13790 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
APOFQ13790 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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APOFQ13790 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
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APOFQ13790 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
APOFQ13790 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
APOFQ13790 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
APOFQ13790 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
APOFQ13790 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
APOFQ13790 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
APOFQ13790 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
APOFQ13790 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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APOFQ13790 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
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APOFQ13790 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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APOFQ13790 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
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APOFQ13790 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
APOFQ13790 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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APOFQ13790 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
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APOFQ13790 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
APOFQ13790 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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