Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
TCIRG1Q13488 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TCIRG1Q13488 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms