Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXE3Q13461 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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