Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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MKRN4PQ13434 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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MKRN4PQ13434 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
MKRN4PQ13434 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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