Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ITGB3BPQ13352 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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ITGB3BPQ13352 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
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ITGB3BPQ13352 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.13□□□□□ -2.39
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ITGB3BPQ13352 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
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ITGB3BPQ13352 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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ITGB3BPQ13352 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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ITGB3BPQ13352 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ITGB3BPQ13352 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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