Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SEMA3BQ13214 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms